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mwbwGenBank è una mwcabanca dati mwcqopen access, istituita nel 1982, che riporta tutte le sequenze di mwcgnucleotidi e le relative mwcwproteine ottenute dopo la loro mwdatraduzione. Il database è prodotto e mantenuto dal mwdqmwdgNational Center for Biotechnology Information (NCBI), che è parte dei mwdwmweaNational Institutes of Health statunitensi, all'interno della mweqmwegInternational Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC).cite-ref-1[1]

GenBank riceve le proprie informazioni dai risultati ottenuti su oltre 300.000 distinti organismi da laboratori sparsi in tutto il mondo,cite-ref-2[2] rappresentando il più importante punto di riferimento nel suo campo di ricerca. La versione 236.0, datata 15 febbraio 2020, contiene oltre 216 milioni di mwhaloci e oltre 399 miliardi di basi da più di 216 milioni di sequenze riportate.cite-ref-3[3]

• Storia

• Invio dei dati

• Note

• Altri progetti

• Collegamenti esterni

L'idea di creare un database per le sequenze di nucleotidi nacque originariamente nel 1979 avendo tra i principali promotori Walter Goad, ricercatore del gruppo di mwjabiologia teorica e mwjqbiofisica presso il mwjgLos Alamos National Laboratory.cite-ref-4[4] Tre anni dopo si ebbe la creazione di GenBank, con il finanziamento dei National Institutes of Health e di altri enti federali. Il Los Alamos National Laboratory iniziò a collaborare con la società mwkwBolt, Beranek and Newman e nel giro di un anno GenBank raccolse oltre 2.000 sequenze.

Verso la metà degli mwlqanni '80 la società mwlgIntelligenetics bioinformatics dell'mwlwUniversità di Stanford gestì il progetto GenBank, sempre in collaborazione con il Los Alamos National Laboratory.cite-ref-5[5] Una tra le prime comunità di mwnabioinformatica presenti su mwnqInternet, il GenBank cominciò a promuovere le comunicazioni scientifiche ad accesso aperto. Tra il 1989 e il 1992 si ebbe il passaggio del progetto al nuovo National Center for Biotechnology Information.cite-ref-6[6]

Possono essere presentate a GenBank solamente sequenze originali. L'invio diretto dei dati può essere effettuato online tramite mwpaBankIt oppure offline utilizzando il mwpqsoftware mwpgSequin. Ricevuta la sequenza, il personale addetto esamina l'originalità dei dati e le assegna un numero d'accesso garantendo il controllo di qualità. Infine i dati vengono inseriti nel database e resi pubblici, diventando raggiungibili attraverso mwpwEntrez o scaricabili via mwqaFTP. Gli invii massivi di mwqqExpressed sequence tag (EST), Sequence-tagged site (STS), Genome survey sequence (GSS), e High-throughput genome sequence (HTGS) sono più spesso opera di centri di sequenziamento su larga scala. GenBank gestisce ed elabora anche sequenze mwrqgenomiche microbiche complete.

cite-note-11. ↑ mwta(mwtqmwtgEN) mwtwmwuaGenBank Overview, su mwuqncbi.nlm.nih.gov. mwugURL consultato il 4 luglio 2016.

cite-note-22. ↑ mwvgE.W. Sayers e I. Karsch-Mizrachi, mwvwmwwaUsing GenBank, in mwwqMethods Mol Biol, vol.mwwg 1374, 2016, pp.mwww 1-22, mwxaDOI:mwxq10.1007/978-1-4939-3167-5_1.

cite-note-33. ↑ mwyq(mwygmwywEN) mwzamwzqDistribution Release Notes (mwzgmwzwTXT), su mwaaftp.ncbi.nih.gov, National Center for Biotechnology Information, 15 febbraio 2020. mwaqURL consultato il 23 febbraio 2020.

cite-note-44. ↑ mwbq(mwbgmwbwEN) Walter B. Goad, mwcamwcqGenBank (mwcgmwcwPDF), su mwdafas.org. mwdqURL consultato il 4 luglio 2016.

cite-note-55. ↑ mweq(mwegmwewEN) mwfamwfqLANL GenBank History, su mwfgbio.net. mwfwURL consultato il 4 luglio 2016.

cite-note-66. ↑ mwgwD. Benton, mwhamwhqRecent changes in the GenBank On-line Service, in mwhgNucleic Acids Res, vol.mwhw 18, n.mwia 6, 1990, pp.mwiq 1517-1520, mwigPMIDmwiw mwja2326192.

Altri progetti

• Wikimedia Commons

• Wikimedia Commons contiene immagini o altri file su GenBank

• mwkq(EN) Sito ufficiale, su ncbi.nlm.nih.gov.